Спарсить подписчиков, которые есть в одной группе ВК и которых нет во второй, как-то можно это сделать?

Парсить, анализировать, производить определенные действия со списками данных ВКонтакте вы сможете с помощью Сервиса поиска целевой аудитории.

Начинайте парсить подписчиков, которые есть в одной группе ВК и при этом их нет в другой, пройдя по ссылке ниже.
Загрузив ссылку на первую группу ВКонтакте, вы спарсите всех подписчиков этой группы ВК.
Повторите то же действие для другой группы ВКонтакте.
Два полученных списка подписчиков этих групп ВКонтакте сравните между собой с помощью парсера (специального инструмента) “Пересечение баз” https://vk.barkov.net/lists.aspx

Выбрав команду “Вычесть из первого списка все элементы второго” вы найдете разницу в подписчиках указанных групп ВК.

Полезный небольшой видеоурок по этой теме

О сервисе поиска аудитории ВКонтакте

vk.barkov.net — это универсальный набор инструментов, который собирает самые разнообразные данные из ВКонтакте в удобном виде.

Каждый инструмент (скрипт) решает свою задачу:
Например, есть скрипт для получения списка всех подписчиков группы.
А вот тут лежит скрипт для сбора списка всех людей, поставивших лайк или сделавших репост к конкретному посту на стене или к любым постам на стене.
Ещё есть скрипт для получения списка аккаунтов в других соцсетях подписчиков группы ВКонтакте.
И таких инструментов уже более 300. Все они перечислены в меню слева. И мы регулярно добавляем новые инструменты по запросам пользователей.

Полезные ответы на вопросы по этому же функционалу для сбора данных из ВКонтакте